Lessius Mechelen ects

Hoofdpagina | Master of Science in de industriële wetenschappen: biochemie

Bio-Informatica (0910MAbio07)


Opleiding Master of Science in de industriële wetenschappen: biochemie Academiejaar 2011-12
Studiepunten 3 Studietijd 75 uur
Creditcontract mogelijkJa
Examencontract(diploma) mogelijk Ja Examencontract (creditbewijs) mogelijk Ja
AardVerplicht QuoteringPunt op 20
Tweede examenkansJa Tolereerbaar Ja

Docenten

  • De Samblanx Gorik

Onderwijstaal

  • Nederlands

Onderwijsvorm

  • Hoorcollege
  • Laboratorium

Begincompetentie

Geen voorkennis vereist

Eindcompetentie

MA_IV_02MA_IV_02 - Praktische vaardighedenGeen omschrijving in gedragsindicatoren in niveaus
MA_KIMA_KI - Diepgaande technische kennisGeen omschrijving in gedragsindicatoren in niveaus
MA_OV_01MA_OV_01 - Kritische reflectie en onderzoekende houdingGeen omschrijving in gedragsindicatoren in niveaus
MA_OV_03MA_OV_03 - Wetenschappelijke wijze denken en handelenGeen omschrijving in gedragsindicatoren in niveaus

Leerresultaten

-de student heeft kennis van theoretische en praktische aspecten die te maken hebben met

het verwerken van DNA sequenties (Ma_KI, MaIV2)



-de student kent en begrijpt de mogelijkheden en beperkingen van een gevorderde

statistische gegevensverwerking, zoals variantie analyse (MaKI, Ma_OVI)



-de student kan deze kennis in de praktijk brengen voor een aantal

modelproblemen (Ma_IV2, Ma_OV3)


Inhoud

(A) Introductie tot BioInformatica


  1. Kennismaking met biologische databanken

  2. Assembleren van genetische informatie

  3. Aligneren van een genetische sequentie met een databank

  4. Classificeren van genetische sequenties

  5. Constructie van een fylogenetische boom


(B) Introductie tot BioStatistiek


  1. ANOVA: variantie analyse en design of experiments

  2. Meervoudige regressie, interpretatie van resultaten

  3. Inleiding tot methodes van datareductie, als PLS en PCA




Tijdens de labozittingen voeren de studenten deze topics uit op een aantal werkelijke (of geconstrueerde) datasets.

Studiematerialen

cursusmateriaal

materiaal op het leerplatform

Evaluatie

Eerste examenkansTweede examenperiode (juni)Mondeling examen50% De resultaten van het werk tijdens het labo worden gebruikt als leidraad voor de evaluatie van kennis van en inzicht in de aangeboden leerstof.
Eerste examenkansTweede examenperiode (juni)Opdrachten50% Studenten werken enkele cases uit en geven de resultaten ervan vorm in een verslag. Voor afspraken, zie hoorcollege en labozittingen
Tweede examenkansDerde examenperiode (augustus)Mondeling examen100% Studenten werken een verslag uit dat aan dezelfde eisen voldoet als dat van de eerste examenkans. Dit verslag wordt tijdens de mondelinge evaluatie besproken. Voor meer afspraken, contacteer de docent.